資訊系統部
資訊系統部由一位助理處長掌管，負責處理處內一切有關資訊系統的發展和運作、紀錄管理及個人資料私隱保障事宜。
面對不斷轉變的社會及經濟環境，本處一直抱着與時並進、精益求精的態度制定資訊科技策略，以配合21世紀數碼化年代，並積極研究採用各種高新科技，為市民提供有效率和高質素服務，同時確保本處的業務常規及工作程序均遵照《個人資料（私隱）條例》的規定。
資訊系統部按功能劃分為四個科別，負責處理本處資訊系統及相關事宜。資訊系統（發展）科負責制定及推行處內的資訊系統策略和開發新的資訊系統，以應付未來工作需求。資訊系統（運作）科負責管理目前運作的資訊系統，確保系統保安以及不斷優化及更新各系統和有關程序。紀錄及數據管理科負責一切有關資料私隱、公開資料和處內紀錄管理的事宜。科技服務科則為處內電腦系統的應用及發展提供技術支援。前三個科別各由一位首席入境事務主任掌管，而科技服務科則由一位總系統經理掌管。
系統運作
出入境管制系統
二零零七年十二月，羅湖管制站的e-道服務擴展至11歲以下就讀小學的跨境學童。二零一五年五月，跨境學童e-道服務再擴展至落馬洲支線管制站。現時，羅湖及落馬洲支線管制站各設有六條跨境學童e-道。
自二零一二年八月底起，本處已分階段於落馬洲支線、深圳灣、落馬洲、沙頭角、文錦渡及羅湖管制站實施「跨境學童簡易過關程序」。本處人員以便攜式出入境檢查裝置為已登記的跨境學童提供更快捷的出入境檢查服務。
二零零八年五月，機場管制站的e-道服務擴展至18歲或以上持有香港特別行政區旅遊通行證、註有「HKG」區碼的亞太經合組織商務旅遊證或香港國際機場訪港常客證的經常訪港旅客。於二零零九年九月，這項服務進一步擴展至多間航空公司的合資格飛行常客會會員。自二零一二年四月底起，經常訪港旅客如持有無須入境簽證／進入許可來港的有效旅行證件，並在登記時於過去12個月內經香港國際機場訪港三次或以上，以及在香港沒有不良紀錄，亦可登記使用e-道服務。
為使港澳兩地居民出入境更加便利，已登記的澳門永久性居民自二零零九年十二月起可使用設於港澳客輪碼頭及中國客運碼頭的e-道辦理出入境手續。這項安排於二零一一年七月擴展至屯門客運碼頭，其後推展至所有管制站。同樣地，合資格的香港居民亦可使用澳門管制站的自助出入境檢查服務。自二零一六年十二月起，持有《香港特別行政區簽證身份書》的香港非永久性居民和持有《澳門居民往來香港特別行政區旅遊證》的澳門非永久性居民亦可享用此便利措施。
二零零九年三月，本處在羅湖管制站推出「快捷e-道」試驗計劃，為現時可使用e-道服務的18歲或以上已登記的香港居民，提供更快捷的e-道服務。現時，羅湖管制站共設有30條快捷e-道。
自二零一二年一月三日起，持本式往來港澳通行證的合資格經常訪港內地旅客登記成功後，可使用e-道辦理自助出入境檢查手續。隨着內地當局推出卡式電子往來港澳通行證，由二零一四年五月二十日開始，持卡式電子往來港澳通行證的合資格內地旅客亦可使用e-道過關。
截至二零一七年年底，約有990 000名持本式往來港澳通行證內地旅客及530 000名其他經常訪港旅客辦妥登記使用e-道服務。
自二零一三年九月起，本處於落馬洲支線管制站、港澳客輪碼頭及深圳灣管制站推出具語音輔助功能的e-道供視障人士辦理自助出入境手續。該服務於二零一七年十二月擴展至中國客運碼頭。使用此服務的人士只需在e-道入口按下啓動按鈕，新增設的語音系統便會提供適當的語音提示，引導他們完成出入境手續。
根據互相使用自助出入境檢查服務的安排，合資格的香港特區護照持有人可登記使用參與國家／地區的自助出入境檢查服務，而參與國家／地區的合資格護照持有人亦可登記使用香港的e-道服務。本處已與韓國、新加坡、德國及澳洲一起實施這項安排，現正積極與其他國家／地區商討互相使用自助出入境檢查服務，預期陸續會有更多國家／地區成為我們這方面的合作伙伴。
自二零一五年九月起，已辦妥登記的領事團身份證持有人可使用設於各管制站的e-道辦理自助出入境檢查手續。
智能身份證系統
智能身份證系統是一個聯機資訊系統，用以支援申請智能身份證的整個流程，包括預約、登記、印製以至簽發程序。這個系統為引入自助出入境檢查服務奠下基礎。此外，智能身份證亦加入了其他非入境事務的功能，例如圖書證，從而促進智慧城市的發展。
電子護照系統
個案簡易處理系統及電子紀錄計劃
台灣居民及印度國民預辦入境登記
台灣居民預辦入境登記於二零一二年九月一日推出，讓合資格的台灣居民可直接透過電子方式經互聯網提交免費預辦入境登記，無須經由台灣航空公司辦理申請，並可即時顯示申請結果，進一步為來港的台灣居民帶來便利。
印度國民預辦入境登記於二零一六年十二月十九日推出，印度國民可透過電子方式經互聯網提交免費預辦入境登記來港旅遊或過境。
旅遊通行證簽發系統
旅遊通行證簽發系統支援簽發旅遊通行證給經常訪港的旅客。旅遊通行證上的電腦可讀資料透過光學字體辨讀機輸入系統，持證人可在各管制站的「香港居民」櫃枱快捷地辦理出入境手續。
亞太經合組織商務旅遊證簽發系統
香港自一九九八年五月二十九日起加入亞太經合組織商務旅遊證計劃。此計劃利用電子數據聯通系統，方便獲認可的商務旅客在前往亞太區各成員地區前，能預先申請批核入境申請。來港的商務旅遊證持有人可使用各管制站內的「香港居民」櫃枱辦理出入境手續。
政府辦公室電腦化系統
政府辦公室電腦化系統為本處內部及香港特區政府各決策局與部門之間，提供快捷的通訊和發布消息的途徑。
政府與僱員電子服務
電子處理假期申請系統是首個政府與僱員電子服務項目。本處所有員工均可透過本處任何已聯網的電腦工作站，在網上處理假期申請、計算及紀錄假期。
行動及行政支援資訊系統
行動及行政支援資訊系統是一個聯機資訊系統，旨在提升行動及行政範疇的工作效率。該系統令人事、物料供應及存貨資料的管理更為方便。
電子紀錄（行政）系統
內聯網
本處的內聯網提供電子渠道供迅速發放多媒體資訊，加強員工的溝通，並作為線上自學課程的平台。二零一七年，瀏覽內聯網的人次約354 萬，每日平均約 9 700人次。
入境事務處網頁
為向市民提供更優質的服務，本處自一九九六年五月三十一日起設立網頁。互聯網使用者除了可透過本處網頁獲得最新的消息和資訊外，亦可透過網頁連結瀏覽相關政府部門／機構的網站。
資訊匯庫
資訊匯庫系統提升了部門提供及分析各類數據的能力，以便管理層參考並作出決策及資源規劃。
流動應用程式
紀錄及數據管理
本處十分重視個人資料私隱及紀錄管理，致力確保業務常規、工作程序及所持有的個人資料及紀錄，均按照《個人資料（私隱）條例》、其他相關法例、規例及指引來處理。本處制定、定期審視和更新部門保障個人資料和紀錄管理的政策、工作指引及程序，確保員工在處理個人資料時，均遵守有關規定，以及妥善管理各項紀錄。為提升本處保障個人資料私隱和紀錄管理，本處已推行「私隱管理系統」，並成立「私隱循規監察小組」以監控部門整體私隱循規情況及檢討相關私隱管理系統。與此同時，本處亦舉辦培訓講座、研討會和工作坊，提高員工對保障個人資料私隱和良好紀錄管理的意識，以及處理查閱個人資料和索取資料申請的能力，從而培養尊重私隱的文化。
電子服務
電子服務自二零零七年十月三十日起分階段於香港政府一站通網站推出。截至二零一七年十二月三十一日，市民和其他有關人士可通過香港政府一站通網站使用的電子服務包括：
- 申領出生／死亡／結婚證明書副本及翻查有關資料；
- 申請香港特區護照（適用於11歲或以上的申請人）；
- 申請核實永久性居民身份證資格及遞交補充文件；
- 申請延長逗留期限及遞交補充文件（訪客及個別申請類別除外）；
- 申請「輸入中國籍香港永久性居民第二代計劃」的入境簽證；
- 預約遞交擬結婚通知書及遞交婚姻登記所需資料；
- 預約辦理出生登記及遞交出生登記所需資料；
- 預約登記申領香港智能身份證；
- 預約申請香港特區旅行證件；
- 預約領取香港特區護照或簽證身份書；
- 預約申請延長逗留期限（訪客及個別申請類別除外）；
- 更改／查詢有關核實永久性居民身份證資格查核證明文件的預約；
- 查詢有關核實永久性居民身份證資格的申請狀況；
- 查詢有關香港簽證的申請狀況；
- 通知提前終止外籍家庭傭工的僱傭合約；
- 舉報違反入境條例罪行；
- 申請索取入境事務處資料；
- 申請無結婚紀錄證明書；
- 預辦台灣居民入境登記；以及
- 預辦印度國民入境登記。
以電子方式提交資料
自二零零零年起，市民可根據《電子交易條例》指定的規格、方式及程序，以電子方式申請多項本處的服務，例如航機機長根據《入境條例》的規定提交列載全體機員和乘客的訂明詳情，以及市民根據《婚姻條例》的規定提出在教堂舉行婚禮而申請婚姻登記官證明書的要求。詳情可參閱本處網頁www.immd.gov.hk.
電子表格
申請人除可親身或以郵遞方式提交申請外，亦可使用本處為市民而設的電子表格，填妥後經由互聯網遞交本處。申請範圍包括：
- 變更登記事項通知書；
- 更改地址通知書；
- 更改香港身份證登記事項申請書；以及
- 申請索取資料表格。
市民可於本處網頁下載這些電子表格。
推行第三代資訊系統策略
為改善服務質素，本處在二零一零年三月委聘顧問進行第三代資訊系統策略檢討，以制定長遠的資訊系統策略。有關檢討建議部門應推行以下獨立而又相互關聯的系統，以提升其服務質素和處理能力，應付日後具挑戰性的業務需求。
- 新資訊科技基建設施；
- 出入境管制系統；
- 新一代智能身份證系統；
- 新一代電子護照系統；
- 新一代個案簡易處理系統，包括：
- 簽證自動化系統；
- 協助在外港人、生死及婚姻、居留權決策支援系統；
- 執法個案處理系統；以及
- 人力資源管理系統。
為配合第三代資訊系統的推行，「新資訊科技基建設施」項目下的兩所數據中心及一個新資訊科技基建設施已分別在二零一四年及二零一五年投入運作。建基於新的資訊科技基建設施，「出入境管制系統」已於二零一七年全面推行。
「新一代電子護照系統」項目的招標工作已經完成，而系統設計工作現已展開。此項目預計可自二零一九年年初起分階段推行。新系統主要用以取代日漸老化的現有電子護照系統和更有效地支援簽發新香港特區旅行證件的工作。另外，「新一代個案簡易處理系統」項目現正就撥款申請及招標進行籌備工作，預計可自二零二一年年初起分階段推行。