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管制部
管制部由一位助理处长掌管，辖下设有四个科，分别为机场管制科、边境管制（铁路）科、边境管制（车辆）科及港口管制科。机场管制科和边境管制（铁路）科各由一位高级首席入境事务主任领导，而边境管制（车辆）科和港口管制科则各由一位首席入境事务主任主管。这四个科别共同分担出入境管制的职责，包括拒绝让不受欢迎人物入境和防止通缉犯离境，以及为旅客提供方便的出入境服务。
 管制部组织图出入境管制站
香港入境处在执行出入境管制工作方面，做法有别于某些地方的出入境管制部门，本处需要检查每一名经海陆空任何一路进出香港的人士。实施有效的出入境管制，对维持法纪及与世界各国和地区保持和睦关系，至为重要。透过执行出入境检查，不但可阻截通缉犯，亦可防止不受欢迎人物进入香港。除非享有香港居留权或入境权，入境旅客必须符合一般的入境要求，包括持有有效旅行证件、带备足够旅费和返回原居地的条件。若旅客未能符合以上条件或其访港目的有可疑，将被拒入境及遣返。二零一一年，共有23 876名旅客被拒入境。
入境处一直致力在各管制站提供高效率和殷勤有礼的服务，并且不断制定新措施，方便旅客进出香港。这样可令游客甫抵港即感到宾至如归，亦会对香港留下良好印象，觉得香港人亲善有礼。
 入境处致力在各管制站提供快捷有礼的服务。机场管制科
机场管制科负责在香港国际机场执行出入境管制的工作。
旅客流量
香港国际机场是全球最繁忙的机场之一。二零一一年，使用机场出入境的旅客达3 550万人次。
 二零一一年，机场出入境旅客达3 550万人次。由二零一零年一月开始，机场管制科进一步提升服务承诺，让98%的香港居民及95%的访客在15分钟的等候时间内完成出入境检查手续。二零一一年，100%的香港居民及98.1%的访客都可在机场管制站于15分钟的等候时间内完成出入境检查手续。
突击检查
机场管制科为防止不受欢迎人士入境及遏止非法移居活动，不时在机场出入境大堂、过境候机室、转机区和登机闸口进行突击检查。二零一一年，共有327人因行使伪造旅行证件及签证等活动而被调查。
顾客服务
为向旅客提供便捷的服务，机场管制科于二零零六年十一月在机场内的各个出入境大堂设立「专用服务柜台」。各个专用服务柜台可以作为「礼遇通道」，供外交护照持有人及有需要人士使用。「礼遇通道」亦可用作香港国际机场「访港常客证通道」，方便曾于过去12个月内经由香港国际机场到访香港三次或以上并获香港机场管理局（机管局）签发访港常客证的旅客。截至二零一一年十二月三十一日为止，机管局已发出87 020张访港常客证。
 「礼遇通道」及「访港常客证通道」让外交护照持有人、经常访港的旅客以及其他有需要人士更快捷地办理出入境手续。商用航空中心
因应商用航空服务所需，香港国际机场的商用航空中心以用者自付的原则，向乘搭私人飞机或包机的旅客提供方便的出入境检查服务。二零一一年，共有6 505班航机及44 760名旅客及机员使用该中心。
海天客运码头
位于香港国际机场旁的海天客运码头为往来机场与珠江三角洲八个口岸，包括广州南沙、深圳蛇口及褔永、东莞虎门、中山、珠海九洲、澳门外港客运码头及氹仔的旅客提供过境旅客服务。使用海天客运码头的过境旅客无须办理一般的出入境及海关检查手续，可以直接在香港国际机场过境。现时共有73间航空公司在海天客运码头提供办理登机服务。二零一一年，共录得超过166万名抵港及73万名离港的过境旅客使用海天客运码头。
为进一步提升服务，蛇口、褔永、虎门及澳门外港客运码头均设有一站式跨境预办登机服务。在这些口岸乘搭海天码头渡轮前往香港国际机场转乘飞机的旅客，可在码头即时领取登机证及托运行李，然后乘船抵达香港国际机场直接登机。现时有十间航空公司参与提供这项服务。
经常访港旅客e-道
由二零零八年五月十九日起，18岁或以上的旅客，如持有有效的香港特别行政区旅游通行证、注有「HKG」区码的亚太经合组织商务旅游证或香港国际机场访港常客证，在香港入境处成功登记后，便可于香港国际机场享用自助出入境检查服务。现时在香港国际机场设有10条经常访港旅客e-道，其中6条设于入境大堂，4条设于离境大堂。由二零零九年九月七日起，此项服务已推广至参加这项安排的航空公司的飞行常客会特选会员。截至二零一一年十二月三十一日，已经登记的经常访港旅客有67 630人，曾经使用自助出入境检查服务的抵港旅客有603 308人次，而离港旅客则有532 705人次。
登记处位于香港国际机场的入境大堂，登记手续无需收费。
 合资格的经常访港旅客，在入境处成功登记后，便可使用自助出入境检查服务。边境管制（铁路）科
边境管制（铁路）科辖下设有三个边境管制站，分别位于罗湖、红磡和落马洲支线。罗湖和落马洲支线管制站负责处理乘搭港铁的旅客人流，而红磡管制站则为乘搭直通火车往来内地与香港的旅客提供出入境检查服务。
罗湖管制站
罗湖管制站是全港最繁忙、出入境旅客流量最高的出入境管制站。二零一一年，经罗湖管制站出入境的旅客达9 300万人次，较二零一零年增加1.6%，但其中访港旅客的增幅则超过15%，达2 000万人次。
 罗湖管制站的「快捷e-道」为已登记的香港居民提供更快捷的e-道服务。此外，每逢节日，罗湖管制站的旅客流量均极高。二零一一年，每日平均旅客流量约为25万人次。在周末或节日期间，每日的旅客人数更经常超过30万人次。为了应付节日期间庞大的旅客流量，本处须从其他组别抽调额外人手到罗湖管制站增援。二零一一年，99.7%的旅客可在30分钟内办妥出入境检查手续。
 合资格的内地旅客自二零一一年十二月五日起，可登记使用罗湖管制站的ｅ-道。罗湖管制站共设有六条「学童e-道」，以加快处理跨境学童的出入境手续。此外，为便利经常访港内地旅客来港，由二零一一年十二月五日起，罗湖及其他特定管制站，包括落马洲支线、深圳湾、中国客运码头、港澳客轮码头及机场管制站，均设有经常访港内地旅客免费登记使用e-道的服务。合资格并已登记的旅客可在二零一二年一月三日起，使用罗湖、落马洲支线、深圳湾、中国客运码头、港澳客轮码头及机场管制站所设的访港旅客e-道，办理自助出入境检查手续。
 罗湖管制站为跨境学童设立特定e-道。红磡管制站
红磡管制站为乘搭直通火车往返内地的旅客办理出入境手续。现时每日有26班往返内地的直通火车，服务范围包括广东省的东莞、广州、佛山及肇庆，更远及上海及北京。二零一一年，经红磡管制站出入境的旅客人数达390万人次，较上一年增加16.6%，而99.9%的旅客能在30分钟内办妥出入境检查手续。
落马洲支线管制站
落马洲支线管制站坐落于港铁东铁线的落马洲总站，是另一个连接铁路的陆路管制站。车站旁设有公共运输交汇处，方便跨境旅客转乘专利巴士、专线小巴或的士。管制站与福田口岸由一条双层跨境行人天桥连接。
二零一一年，超过3 410万人次经落马洲支线管制站出入境。自管制站投入服务以来，使用率明显上升，于二零一一年，过关的旅客每日平均有93 633人次，较二零一零年的79 091人次增加18.4%。二零一一年，99.1%的旅客能在30分钟内办妥出入境检查手续。
 落马洲支线管制站于二零零七年八月十五日开始运作，与福田口岸由一条双层跨境行人天桥连接。 落马洲支线管制站入境大堂
边境管制（车辆）科
 设于管制站的车辆e-道能为跨境司机提供方便快捷的出入境检查服务。边境管制（车辆）科辖下设有四个边境管制站，分别位于落马洲、文锦渡、沙头角和深圳湾。这四个出入境管制站负责为跨境车辆，以及乘搭穿梭巴士（只限在落马洲）、旅游巴士或私家车往来内地与香港的乘客办理出入境检查手续。
落马洲管制站
自深圳湾管制站于二零零七年七月一日开始运作后，落马洲管制站的繁忙交通得以略为纾缓。在二零一一年，经落马洲管制站跨境的车辆共有970 万架次，当中的跨境私家车有384 万架次，较二零一零年度上升3.9%。此外，经落马洲管制站出入境的旅客人数达3 137 万人次，当中访客录得891 万人次，占旅客人数的28.4％。在二零一一年，约99%的旅客能在30 分钟内办妥出入境检查手续。
落马洲管制站24小时旅客通关
落马洲管制站由二零零三年一月二十七日起实施24小时旅客通关。二零一一年，在通宵时段内（由午夜至翌日早上六时三十分）过关的旅客每日平均有13 900人次，而在周末或公众假期，平均流量则超过16 800人次。
落马洲管制站客运大楼于二零一一年十一月进行改善工程，工程包括加设e-道，由现时的20 条增加至33 条，并改善客运大楼内各相关部门的设施，整项工程预计于二零一三年分阶段完成。
文锦渡管制站
 文锦渡管制站由于深圳文锦渡口岸旅检区域于二零一零年二月二十二日起因开展改建工程而关闭，文锦渡管制站的出入境旅客检查服务亦相应暂停，但管制站仍然维持对货车及跨境学童的通关服务。因应市民的需要，来往上水及文锦渡口岸的过境巴士由二零一零年三月二十七日开始，在每天上午七时至九时和下午六时至八时期间提供有限度服务。二零一一年，经文锦渡管制站出入境的旅客人数有17万人次，较二零一零年减少约66%。二零一一年，所有经文锦渡管制站出入境的旅客均能在30分钟内办妥出入境检查手续。
文锦渡管制站客运大楼的改善工程已于二零一一年年初开始动工。工程在二零一二年完成后，e-道的数目将会由原来的9条增至18条。
沙头角管制站
 沙头角管制站沙头角管制站每天由上午七时至晚上十时开放，为跨境车辆及旅客提供出入境检查服务。旅客主要乘坐跨境旅游巴士、出租汽车或私家车穿梭内地与香港。二零一一年，经沙头角管制站出入境的旅客人数达310万人次，较二零一零年增加约8%。二零一一年，所有旅客均能在30分钟内办妥出入境检查手续。
沙头角管制站于二零零九年七月一日开始将晚上的通关时间延长两小时，延长后的服务时间为早上七时至晚上十时。新安排为使用该管制站的旅客及货运车辆带来更大的方便。
沙头角管制站于二零零九年八月起开始试行跨境学童免落地过关检查计划，现时每天共有七班旅游巴士接载北区两间幼稚园的跨境学童往返深圳与新界北区。二零一一年，每日平均有242人次使用此项服务。
深圳湾管制站
 深圳湾管制站深圳湾管制站是首个采用「一地两检」运作模式的边境管制站，为往来内地与香港的旅客和车辆提供出入境检查服务。
在此运作模式下，乘坐跨境巴士的旅客只需上落车辆一次，便可在同一旅检大楼内办理香港及深圳两地的出境及入境检查手续，大大节省过关时间。此外，每个车辆检查亭内的入境处与海关工作室皆为相连间隔，可为跨境车辆提供一站式清关服务。
管制站开放时间为上午六时三十分至晚上十二时。现时已有多条穿梭内地与香港的跨境巴士线投入服务。香港深圳湾口岸的公共交通转换站亦为旅客提供了多种公共交通服务，包括市区或新界的士、专利巴士和专利小巴。
经深圳湾管制站出入境的旅客人数持续增加，由二零一零年的平均每日58 600人次增加至二零一一年的68 600人次，增幅接近17%。
二零一一年，平均每日车辆交通流量为9 500架次，较二零一零年的8 800架次增加8.4%。其中66%为私家车辆，26%为货车，其余为旅游巴士。
交通流量数字显示，深圳湾管制站已渐受旅客欢迎，在分流其他陆路边境管制站交通上担当了重要角色。二零一一年，超过98%的旅客能在30分钟内办妥出入境检查手续。
港口管制科
港口管制科负责为经港口进出香港的人士提供出入境检查服务。港口管制科辖下共设有四个管制组，分别为港口管制组、港澳客轮码头管制组、中国客运码头管制组及屯门客运码头管制组。
港口管制组
 入境处工作船港口管制组的其中一项职责，是在两个指定的入境船只碇泊处，即东面检疫及入境船只碇泊处和西面检疫及入境船只碇泊处，为进出香港船只上的人士办理出入境检查手续。二零一一年，港口管制组共为182 291艘进出香港船只上的人士办理出入境检查手续，较二零一零年增加0.2%。
此外，港口管制组亦负责处理船员的遣返、紧急登岸、弃职及偷渡等事宜。为了加强对船只抵港后的检查，港口管制组属下的船只搜查小组会定期搜查及突击检查在香港水域的船只，确保所有抵港船只均符合入境规定。
  船只搜查小组经常在本港水域突击检查船只，以打击非法入境活动。船只搜查小组由四支行动小队及一支情报及支援小队组成。行动小队负责在香港水域搜查及突击检查船只，以便侦查规避出入境检查、伪造证件、非法入境及逾期逗留等个案，以加强海上出入境管制及打击非法入境活动。情报及支援小队则负责收集及分析有关资料和情报。
预办入境检查计划
为促进货运及物流业的业务，港口管制科已推行预办入境检查（预检）计划多年。在这计划下，事先获批准的船只可直接驶往停泊处或码头起卸货物，而无须在入境船只碇泊处等候办理入境检查手续。二零一一年，共有25 891艘远洋船只及54 295艘内地内河及沿海货船获准按预检计划进入香港。
这项安排大大节省船只的经营成本及时间，并有助加强和提升香港作为国际及区域首选运输和物流枢纽的地位。
港澳客轮码头管制组
二零一一年，经港澳客轮码头往来澳门及广东省邻近口岸的旅客总数达1 790万人次，较二零一零年增加大约3.2%。港澳客轮码头是所有港口管制站中最繁忙的口岸，旅客中大部分是香港居民，出入境人次约有1 160万，占整体流量的65%，而访港旅客的比率于近年亦逐渐增加。码头为24小时运作，每天约有300班客轮往返香港与澳门或内地。另外，每天亦有约50班直升机提供往返香港与澳门的服务。
港澳客轮码头管制站现设有46条e-道，其中8条可供澳门永久性居民使用。
 港澳客轮码头
 港澳客轮码头管制站现设有8条e-道可供澳门永久性居民使用。中国客运码头管制组
中国客运码头管制组负责为在中国客运码头乘坐客轮往返香港与内地或澳门的旅客提供出入境检查服务。此外，该组亦派员往海运大厦，为碇泊该处以香港为母港的邮轮旅客提供出入境检查服务。
二零一一年，中国客运码头每日平均处理约129班往返香港与澳门及内地的客轮。同年，中国客运码头处理的旅客达842万人次，当中包括66万人次的邮轮旅客，较二零一零年上升6.3％。旅客当中，45.7％是访港旅客。
中国客运码头现设有22条e-道，让旅客以自助形式办理出入境检查手续。
屯门客运码头管制组
 屯门客运码头屯门客运码头管制组辖下的屯门客运码头管制分组负责在屯门客运码头为旅客提供出入境检查服务，而内河码头管制分组则为内地内河及沿海货船提供出入境检查服务。
屯门客运码头的营运公司获得有关当局批准，于二零一一年四月十五日开始营办往返香港与澳门的航线。二零一一年，经屯门客运码头出入境的旅客共有255 006人次，当中95%为香港居民。年内，全部旅客均能在30分钟内办妥出入境检查手续。
自二零一一年七月六日起，出境及入境大堂各开放三条e-道给已登记的澳门永久性居民使用。
内河码头管制分组负责在入境船只屯门碇泊处为内地内河及沿海货船提供24小时出入境检查服务，以纾缓马湾海峡的繁忙情况及促进贸易活动。二零一一年，每日平均有90艘内河船在该碇泊处办理出入境检查手续。此外，内河码头管制组亦负责处理船员的遣返、紧急登岸、弃职及偷渡等事宜。
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